Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpraP18052 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpraP18052 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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