Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms