Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgbP16014 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgbP16014 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms