Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp1P12032 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp1P12032 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp1P12032 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms