Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga5P11688 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga5P11688 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga5P11688 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga5P11688 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga5P11688 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga5P11688 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga5P11688 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga5P11688 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga5P11688 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga5P11688 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga5P11688 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga5P11688 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga5P11688 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga5P11688 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms