Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms