Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms