Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms