Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms