Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf1P09925 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms