Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms