Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb5P09079 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hoxb5P09079 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hoxb5P09079 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Hoxb5P09079 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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