Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms