Protein–RNA interactions for Protein: P08228

Sod1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod1P08228 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sod1P08228 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms