Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

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Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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