Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms