Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06344 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06344 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06344 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06344 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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