Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06320 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06320 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06320 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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