Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P04212 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P04212 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P04212 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P04212 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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