Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01678 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01678 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01678 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01678 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01678 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01678 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01678 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms