Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01673 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01673 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01673 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01673 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01673 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01673 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01673 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01673 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01673 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01673 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01673 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01673 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01673 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01673 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01673 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01673 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01673 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01673 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
P01673 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01673 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01673 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01673 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01673 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01673 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01673 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01673 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01673 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01673 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01673 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01673 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01673 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01673 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms