Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01672 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01672 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01672 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01672 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01672 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01672 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01672 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01672 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01672 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01672 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01672 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01672 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01672 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01672 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01672 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01672 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01672 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01672 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01672 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01672 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms