Protein–RNA interactions for Protein: P01670

Ig kappa chain V-III region PC 6684, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01670 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01670 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01670 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01670 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01670 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01670 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01670 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01670 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01670 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01670 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01670 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01670 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01670 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01670 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01670 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01670 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01670 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01670 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01670 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01670 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01670 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01670 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01670 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01670 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01670 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01670 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01670 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01670 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01670 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01670 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01670 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01670 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms