Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01669 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01669 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01669 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01669 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01669 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01669 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01669 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01669 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01669 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01669 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01669 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01669 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms