Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01667 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01667 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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