Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01635 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01635 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01635 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01635 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01635 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01635 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01635 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01635 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01635 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01635 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01635 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01635 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01635 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01635 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01635 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms