Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lancl1O89112 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lancl1O89112 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms