Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp1O89090 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sp1O89090 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp1O89090 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms