Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CopeO89079 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CopeO89079 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CopeO89079 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CopeO89079 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopeO89079 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopeO89079 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopeO89079 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopeO89079 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms