Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3pxd2aO89032 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3pxd2aO89032 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms