Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd160O88875 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms