Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CcnkO88874 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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CcnkO88874 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CcnkO88874 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms