Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
JtbO88824 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
JtbO88824 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
JtbO88824 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
JtbO88824 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
JtbO88824 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
JtbO88824 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
JtbO88824 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
JtbO88824 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
JtbO88824 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
JtbO88824 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
JtbO88824 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
JtbO88824 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
JtbO88824 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
JtbO88824 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
JtbO88824 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JtbO88824 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JtbO88824 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms