Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn3O88705 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms