Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms