Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid1O70583 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid1O70583 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms