Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtssO70370 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtssO70370 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtssO70370 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtssO70370 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtssO70370 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtssO70370 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtssO70370 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtssO70370 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms