Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms