Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtogO55225 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtogO55225 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OtogO55225 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
OtogO55225 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
OtogO55225 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
OtogO55225 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
OtogO55225 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms