Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb2O55203 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms