Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms