Protein–RNA interactions for Protein: O55189

Ambn, Ameloblastin, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbnO55189 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbnO55189 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbnO55189 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbnO55189 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbnO55189 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbnO55189 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbnO55189 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbnO55189 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbnO55189 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbnO55189 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbnO55189 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbnO55189 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbnO55189 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbnO55189 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbnO55189 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmbnO55189 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbnO55189 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbnO55189 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms