Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sap18O55128 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sap18O55128 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms