Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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BckdkO55028 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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BckdkO55028 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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BckdkO55028 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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BckdkO55028 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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