Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole2O54956 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms