Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NlkO54949 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NlkO54949 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NlkO54949 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NlkO54949 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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NlkO54949 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NlkO54949 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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