Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp10aO54827 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp10aO54827 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms