Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DffaO54786 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DffaO54786 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DffaO54786 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DffaO54786 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DffaO54786 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DffaO54786 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DffaO54786 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DffaO54786 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DffaO54786 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DffaO54786 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DffaO54786 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DffaO54786 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DffaO54786 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DffaO54786 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DffaO54786 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DffaO54786 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DffaO54786 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms