Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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