Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FxnO35943 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FxnO35943 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FxnO35943 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FxnO35943 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FxnO35943 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FxnO35943 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FxnO35943 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FxnO35943 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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